Ya que el lupus es una enfermedad de difícil diagnostico es probable que el paciente pase por diferentes instancias antes de llegar a tener una confirmación.

En el caso de la enfermedad lupus la única forma de llegar a un diagnóstico certero es mediante un extenso estudio del paciente que implica tanto preguntas como análisis de laboratorio. Para que las preguntas sean adecuadas, los estudiosos han dado con un criterio de puntos que sirven para guiar al médico en su diagnostico.

El primer indicador que un médico debe contemplar para realizar el diagnostico es que el paciente tenga o haya tenido enfermedades en múltiples sistemas, es decir que varias anomalías estén presentes en la misma persona.

A modo de ejemplo se puede decir que se dirá que es lupus el diagnostico cuando el paciente presente todos o varios de estos síntomas:

En la piel: manchas rojizas, si son en la cara se deben extender a ambas mejillas pasando sobre la nariz; úlceras en el paladar y la pérdida del cabello.
En las articulaciones: dolor, enrojecimiento, hinchazón.
En los riñones: sedimento anormal que sugiere enfermedad renal.
En las membranas: inflamación de alguna o todas las membranas, pleuresía, pericarditis, peritonitis.
En la sangre: anemia, leucopenia, trombocitopenia.
En los pulmones: manchas que se ven con radiografía que se pueden deber a la acumulación de células.
En el sistema nervioso: convulsiones, psicosis, anormalidades de nervios periféricos que causan sensaciones extrañas o alteraciones de la capacidad muscular.

Los exámenes de laboratorio deben buscar signos de enfermedad autoinmune para que se diga que es lupus el diagnostico que corresponde al paciente.

Estos exámenes buscan anticuerpos antinucleares, que son los autoanticuerpos que reaccionan con los componentes del núcleo celuar. Otro de los análisis, que se utiliza menos frecuentemente es el que analiza la célula LE que está siendo reemplazado por el estudio que mencionamos antes.

Otro de los análisis que se realiza es el de anticuerpos anti-DNA que es la que indica si el organismo está atacando al material genético de la célula.

Entre estos y otros análisis como el de anti-Sm que busca daño a una determinada proteína ribonucleica, se realizan por separado o juntas para determinar un diagnostico confiable de que los síntomas que se manifiestan son de lupus y no de otras enfermedades.