El tratamiento del ovario poliquístico dependerá de la presentación clínica. La infertilidad requerirá inducción de la ovulación medicamente o cirugía. Si la fertilidad no es deseada la regulación menstrual con anticonceptivos orales puede ser requerida. Debe tomarse en cuenta que la menstruación infrecuente puede llevar a hiperplasia del endometrio y a malignización. Es por eso que es obligatorio inducir el sangrado menstrual en pacientes con amenorrea u oligomenorrea severa cada 3 a 4 meses, aún si los ciclos regulares no son deseados.